В течение 2006 года предприятия муниципального транспорта сократили свои убытки на 134 млн рублей. В начале ноября была закончена реорганизация троллейбусных депо, которые стали подразделениями МУП «Горэлектротранспорт». Начальник департамента транспорта и дорожно-благоустроительного комплекса мэрии Андрей Ксензов говорит, что реорганизация продолжится, и в ближайшие месяцы затронет трамвайные депо и несколько автотранспортных предприятий.
По его словам, делается все возможное и по получению дополнительных доходов муниципальным транспортом, и по его «финансовому оздоровлению». При этом, отмечает Андрей Ксензов, муниципальный транспорт за первые девять месяцев 2006 года заплатил не менее 63 % налогов в бюджеты различных уровней. В прошлом году это было 35-37 %. По его словам, в целом городской муниципальный транспорт Новосибирска по-прежнему остается «планово убыточным».
В новосибирском муниципальном транспорте на сегодняшний день работают 313 троллейбусов, 189 трамваев, 547 автобусов, 98 маршрутных такси и 32 «волги» (муниципальное такси). В то же время 2412 транспортных средств в Новосибирске представляют немуниципальных пассажироперевозчиков.